中新社北京6月8日電 (記者 孫自法)記者8日從中國科學(xué)院微生物研究所(中科院微生物所)獲悉,該所劉雙江研究團(tuán)隊(duì)歷時兩年研究,最新已建成資源豐富的健康人群腸道微生物菌株資源庫(human gut microbe biobank, hGMB),為構(gòu)建中華腸道微生物資源庫奠定了重要基礎(chǔ)。
劉雙江研究員介紹,hGMB包括400個不同物種,其中102個物種為首次分離、培養(yǎng)和鑒定,1170株代表性菌株保存在中國普通微生物菌種保藏中心,已向科研界和產(chǎn)業(yè)界提供數(shù)次菌株服務(wù),支持腸道微生物功能開發(fā)和微生物-宿主互作的研究。為更加充分發(fā)揮和挖掘菌株資源的價值,hGMB物種信息已在官網(wǎng)公布。
構(gòu)建中華腸道微生物資源庫具有長遠(yuǎn)戰(zhàn)略意義和經(jīng)濟(jì)社會價值。hGMB構(gòu)建過程中,研究團(tuán)隊(duì)從239例來自不同地區(qū)、不同年齡的體檢健康人群的新鮮糞便樣品中挑取超過2萬個單克隆菌落,擴(kuò)大培養(yǎng)后從中鑒定出超過1萬個純培養(yǎng)分離株,并對本次發(fā)現(xiàn)的全部新物種進(jìn)行基因組測序和分類學(xué)描述與命名。
研究團(tuán)隊(duì)通過對健康人腸道宏基因組分析,發(fā)現(xiàn)菌株資源庫中的85個新物種出現(xiàn)在超過90%健康人腸道中。進(jìn)一步對全球人腸道相關(guān)數(shù)據(jù)分析表明,hGMB覆蓋79%人腸道已知常見菌屬和75%常見物種;與目前最大的人腸道基因組數(shù)據(jù)庫(UHGG)比對發(fā)現(xiàn),hGMB貢獻(xiàn)出24個在腸道免培養(yǎng)組學(xué)研究中未被探測到卻普遍存在的“暗”物種。
越來越多的證據(jù)表明,腸道微生物與宿主健康和生長發(fā)育密切相關(guān),在未來人體健康管理和醫(yī)療產(chǎn)業(yè)發(fā)展中,腸道微生物資源潛力巨大,在揭示宿主表型與腸道菌群因果關(guān)系的研究中,也發(fā)揮至關(guān)重要作用。由中科院微生物所劉雙江、劉暢、杜夢璇、熱西丁·阿不都艾尼、于海英等共同完成hGMB構(gòu)建的重要成果論文,近期已在國際專業(yè)學(xué)術(shù)期刊《微生物組》(Microbiome)發(fā)表。
中科院微生物所稱,在成功構(gòu)建hGMB之前,劉雙江團(tuán)隊(duì)2020年還發(fā)表迄今最大的模式動物小鼠腸道微生物資源庫(mGMB),mGMB包含126種微生物及其基因組,其中77種微生物是首次成功分離培養(yǎng)的新物種,使得可培養(yǎng)的小鼠腸道微生物菌株資源從48屬76種增至110屬180種,并在此過程中形成一套厭氧微生物分離培養(yǎng)與物種鑒定描述的最簡標(biāo)準(zhǔn)化流程。(完)